일러스트레이터에서의 가이드라인을 기준으로 한 슬라이스는 무조건 정확한 픽셀사이즈로만 슬라이스가 됩니다.
포토샵도 동일한 방식이지만, 애초에 픽셀 그리드 기준의 소프트웨어이다 보니 항상 정확하게 잘리는 것입니다.

따라서, 작업 시작 전에
1. RGB 모드에서
2. 픽셀 그리드를 켜신 상태에서
3. 모든 유닛의 세팅을 픽셀로 바꾸신 후,
4. 모든 개체를 픽셀 퍼펙트(정확한 정픽셀 사이즈, 0.xxx픽셀로 떨어지는 사이즈와 X,Y 좌표는 안됩니다.) 하게 작업하시는 것이 중요합니다.
단, 1px 라인의 경우에는 Y 좌표값이 항상 원하시는 위치 값_0.5PX 이어야 픽셀이 깨지지 않습니다.

슬라이스의 개념이 웹과 모바일 디자인용 이미지 자름의 개념이기 때문에 그렇습니다.

웹/모바일 작업이 아니고 단순히 이미지화가 필요하신 것이라면, 아트보드 기능을 사용하신 후, 해당 아트보드를 이미지로 저장하시는 것이 좋습니다.